由於風間想要學會快速取得積分的方法，而去了秘密地方，在那裡卻遭受到了不知名的襲擊……

隔天一早，風間卻變得跟以前的自己完全不像，不但會露屁屁，還會在大眾面前搞笑，儘管前一晚小新與風間大吵一架，卻不計前嫌，要為風間找出恢復的方法，甚至為了他，創立了偵探社，這或許是因為小孩子天真的樣子吧，在現今社會中，這種場面已經非常少見了。

在小新查案過程中，不小心睡著了，當他醒來時已經被抓到了神秘鐘塔內，且屁屁也被裝上了裝置，此裝置是可以辨識出一個人的分類，但在便是到一半時，風間突然過來搗亂，並且裝在自己的屁股上，此刻機器開啟，居然讓風間變成了超級精英。

在這一幕看似風間在亂，但此刻他應該是不太可以控制自己身體，但內心還是想要保護小新才這樣做吧！

此刻風間已經成為了超級精英，不論運動方面、大腦計算能力、空間感，均都大幅提升好幾個檔次，因此小新便與風間還有最終吸血屁屁王決鬥，在決鬥得過程中，小新無意間從吸血屁屁王身上奪取了一個東西。

但最終還是讓他們跑走了，後來小新一行人與學生會長千潮打算追趕過去，千潮是以前幾乎都是田徑隊第一名，但由於認真時候表情會有劇烈變化，便會被大眾所恥笑，因此對跑步埋下了巨大的陰影。

然而此時風間只想把菁英學院所有人都轉變跟自己一樣的菁英學員，後來小新決定與強化過的風間進行跑步對決，如果輸了全精英學校的學員都必須要變成超級精英。

此時大部分的學員看到風間的模樣，也極為想變成超及精英，但是小新不這麼認同，小新只想要風間變回以前的樣子，極力想要將風間拉回來。

究竟春日部防衛隊與風間的對決如何呢？

到底學員們是否會全部變成精英學員嗎？